V roku 1939 sa profesor Paul Langford a jeho dcéra Catherine stále potýkajú s tajomstvami starovekých pamiatok, ktoré objavili v egyptskej púšti pred viac ako desiatimi rokmi. S blížiacou sa vojnou v Európe a nedostatkom finančných prostriedkov sa tieto brilantné mysle blížia k najnižšiemu odlivu. Málokto vie, odpovede sa chystajú predstaviť v nebezpečnej podobe, keď sa nacistická okultistka Dr. Wilhelm Brücke priblíži k svojmu zariadeniu so zlovestným motívom. Keď Catherine uvedie pomoc dvoch mladých vojakov, musí použiť všetkých svojich vtipov a čestných ľudí ako ona a jej noví spojenci sa vydajú na dobrodružstvo do neznáma, aby zachránili svojho otca a zachránili Zem pred nepredstaviteľnou temnotou. Stargate Origins skúma cestu, ktorou sa mladá Catherine Langfordová snaží odomknúť tajomstvá starodávnej technológie, ktorá môže zmeniť samotný priebeh ľudstva.