Lincoln Burrows je v súčasnosti na rade smrti a je naplánované, že za pár mesiacov zomrie na atentát, ktorého mladší brat Michael je presvedčený, že sa nespáchal. Bez ďalších možností a časovej likvidácie Michael robí drastické opatrenia, aby sa dostal do väzenia spolu so svojím bratom v štáte Fox River State Penitentiary. Akonáhle je vo vnútri, Michael - stavebný inžinier s plánmi pre väzenie - začne vykonávať prepracovaný plán, ako Lincolna vymaniť a dokázať ho nevinným. Keď Michael dorazí do štátnej väznice Fox River, stretne sa s väzenskými obyvateľmi, ktorí nevedomky pomôžu v jeho únikových plánoch - jeho spolubojovník, milostný Sucre; krásna väzenská lekárka Dr. Sara Tancredi, ktorá sa stane dcérou guvernéra; bývalý šéf davov John Abruzzi; a strážca Henryho pápeža. Medzitým mimo väzenských múrov pracuje bratský detský priateľ a Lincolnova stratená láska, právnik Veronica Donovan, zákon, aby ich oslobodil; Lincolnova dospievajúci syn LJ môže ísť po ceste podobnej jeho odsúdenému otcovi; a vyšetrovanie agenta tajnej služby Paula Kellermana v prípade Lincolna dokazuje, že môže dôjsť k národnému sprisahaniu.